Hakkı Atun 1918 yılında Kıbrıs’ın Ergazi köyünde doğdu. Lise öğretimini Lefkoşa İslam Lisesinde tamamlayıp 1936 yılında birincilikle bitirdi. Aynı yıl yatılı burslu olarak Ankara’da Yüksek Ziraat Enstitüsü Baytar Fakültesine girdi. Mezuniyetten sonra İkinci Dünya Savaşı çıkınca Teğmen Rütbesi ile askere alınmış, Edirne’de, Bursa’da ve Kırıkkale’de görev yapmıştır. Savaş bittikten sonra burs kazanarak Amerika Birleşik Devletlerine gitmiş ve yüksek lisansını orada tamamlamıştır. Bu arada Amerika’da Squibb Firmasında Laboratuvar şefliği yapmıştır. 1952 yılında yurda döndükten sonra Elazığ Veteriner Kontrol araştırma Enstitüsünü kurmuştur. Bu arada Enstitüde Şap hastalığının teşhisi ve Antrax (Şarbon) aşısının üretilmesi konusunda öncü çalışmalar yapmıştır. Elazığ’dan sonra tayini İstanbul Pendik veteriner Araştırma Enstitüsüne çıkmıştır. Bu arada Tıp Fakültesinde öğretime başlamıştır. Hakkı Atun 1950 li yıllarda Kıbrıs’a çağırılmış ve bir laboratuvarın başına getirilerek salgın hastalıklarla mücadele konusunda görev almıştır. Kıbrıs’tan sonra Dünya sağlık Teşkilatı kanalıyla Irak’a gitmiş, Bağdat Üniversitesinde Bölüm Başkanı olarak çalışmıştır. Irak’taki salgın hastalıklarla savaş ve Pastör Enstitüsü işbirliğinde aşı üretim çalışmalarında bulunan hakkı Atun İhsan Doğramacı’nın daveti üzerine Türkiye’ye dönerek Hacettepe Üniversitesinde Patoloji Bölüm Başkanı olmuştur.
Kıbrıs Barış Harekatında adaya giden Hakkı Atun Magosa Hastanesinde gönüllü olarak yaralı asker ve mücahitlerin tedavisini yapmıştır. 1975 yılında Ankara’ya dönen Hakkı Atun Kıbrıs Türk Kültür Derneği’nin Genel Sekreteri olarak Türkiye Cumhuriyeti Başbakanı Bülent Ecevit’le Kıbrıs’ta oluşturulan Türk bölgesinin geleceği ile ilgili görüşmeler yapmıştır. Bu görüşmelerde KKTC’de kurulacak sanayinin üniversitelerden oluşması gerektiğini söyler ve KKTC’nin üniversiteler ülkesi olması için çalışmaların hemen başlatılmasını talep eder. Israrlı girişimleri sonucunda önce Yüksek Teknoloji Enstitüsü, sonra da Doğu Akdeniz Üniversitesi kurulur ve Prof. Dr. Hakkı Atun, “Kıbrıs adasının üniversiteler adası olmasının fikir babası” olarak tarihe geçer.
Hacette Üniversitesi Tıp Fakültesi Patoloji Bölümündeki başarıları ona Sivas Cumhuriyet Üniversitesi Tıp Fakültesinin kurucu dekanlığını getirir. Birkaç yıl sonra dönemin Cumhurbaşkanı kendisini Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi’ni kurmakla görevlendirir ve kurduğu üniversitenin ilk rektörü olur. Emekliliği sonrasında KKTC’ye dönen Prof.Dr.Hakkı Atun 1988 yılında Yakın Doğu Üniversitesi’nin Rektörlüğüne atanır.
Başarıları yurt dışında da dikkat çeken Prof. Dr. Hakkı Atun 1988 yılında yayınlanan “Dünya Bilim Adamları” biyografisinde hakkı olan yerini alır. Hakkı Atun 13 Kasım 2009’da vefat etmiş ve Gazimagosa’da defnedilmiştir.